In Lehre und Forschung ist die Mykologie (Pilzkunde) von zentraler Bedeutung, nicht zuletzt aufgrund der enormen Biodiversität und biochemischen Plastizität der Pilze. Biodiversität bezieht sich dabei sowohl auf die Vielfalt pilzlicher Organismen als solche (die sogenannte Funga in Ergänzung zu Flora und Fauna) als auch auf die funktionelle Diversität ihrer biokatalytischen Leistungen. Diese Leistungen sind für Ökosysteme (Kohlenstoff-Kreislauf, Ab- und Umbau von Lignozellulosen, Totholz und Humus) und Biotechnologie (u.a. für die Bereitstellung einer stofflichen Basis für die technische Chemie oder Pharmazeutika) gleichermaßen wichtig. Die mykologische Forschung am IHI Zittau versucht dabei alle Facetten der modernen und klassischen Pilzkunde abzudecken, angefangen von der Funga der Oberlausitz, über die Zersetzung von Totholz in Wäldern, über Pilzkulturen (einschl. Bioreaktionstechnik) und isolierte Enzyme im Labor bis hin zur Genomik der Pilze.