Die erste der sechs Missionen der Zukunftsstrategie lautet: Ressourceneffiziente und auf kreislauffähiges Wirtschaften ausgelegte wettbewerbsfähige Industrie und nachhaltige Mobilität ermöglichen.

„Indem die moderne zirkuläre Wirtschaft nachhaltig erzeugte, nachwachsende Rohstoffe auf vielfältige Weise in Kaskaden oder mehrfach genutzt werden, kann eine nachhaltige Bioökonomie neue Wege eröffnen, um mehr Wertschöpfung mit weniger Ressourceneinsatz zu ermöglichen und dabei Abfälle und Treibhausgasemissionen zu minimieren“, heißt es auf Seite 36 der Zukunftsstrategie.

Um „Moderne Technologien für eine wettbewerbsfähige, kreislauffähige und klimaneutrale Industrie [zu] entwickeln“, werden diese Ziele formuliert:

•     Wir wollen die Potenziale der nachhaltigen Bioökonomie nutzen.
•     Mit einer nachhaltigen Bioökonomie werden wir auch in Zukunft Beiträge für die Entwicklung einer ressourceneffizienten, klimaneutralen Industrie weltweit leisten, die Kreislaufführung und Mehrfachnutzung nachwachsender Rohstoffe steigern, die energetische Nutzung biogener Ressourcen z.B. im Verkehr berücksichtigen, wo dies nachhaltig möglich ist, und dadurch mehr Wertschöpfung unter Beachtung planetarer Belastungsgrenzen mit weniger Ressourceneinsatz ermöglichen.
•     Durch die gezielte Förderung der Biotechnologie als Schlüsseltechnologie werden wir neue Impulse für eine nachhaltige Wertschöpfung in Deutschland legen.
•     Wir setzen uns für innovationsfreundliche Rahmenbedingungen ein und adressieren strukturelle Hürden, um den Transfer von Forschung und Innovation in einer nachhaltigen Bioökonomie zu verbessern.

Auch in der zweiten Mission „Klimaschutz, Klimaanpassung, Ernährungssicherheit und Bewahrung der Biodiversität voranbringen“ kommt der Begriff Bioökonomie mehrfach vor oder ist zumindest gemeint.

Um „Biodiversität [zu] erhalten“, werden diese Ziele formuliert:

• Wir wollen ein Monitoring-System für die Bioökonomie entwickeln, mit dem Umweltbilanzen erstellt und die sozioökonomische Leistungsfähigkeit der Bioökonomie analysiert werden können.
• Wir wollen die sozioökonomischen Zusammenhänge eines Wandels zu einer nachhaltigen, Bioökonomie weiter erforschen, um Zielkonflikte besser zu verstehen und ihnen entgegenzusteuern.

Um „Nachhaltige und resiliente Agrar- und Ernährungssysteme [zu] schaffen“, werden unter anderem diese für die Bioökonomie relevanten Ziele formuliert:

• Wir wollen zu einer zukunftsfähigen, klima-, umwelt- und biodiversitätsgerechten Bodennutzung beitragen.
• Wir wollen nachhaltige, zukunftsfähige Agrar- und Ernährungssysteme ermöglichen.
• Wir wollen die Züchtung und Nutzung von klima- und standortangepassten, robusten und ertragreichen Sorten voranbringen, auch für den ökologischen Landbau.
• Eine starke deutsche Beteiligung in den Programmbereichen/Clustern „Lebensmittel, Bioökonomie, natürliche Ressourcen, Landwirtschaft und Umwelt“ […]  von Horizont Europa wird angestrebt, um die gemeinsame europäische Forschung an diesen Themen voranzutreiben

In der Mission 3: „Gesundheit für alle verbessern“ wird die Biotechnologie erneut als Schlüsseltechnologie hervorgehoben. Ziel sei es, „zum international führenden Biotechnologiestandort zu werden“. Zur Standortsicherung gehöre dabei auch, die Skalierung von Laboransätzen in die industrielle Produktion durch zweckmäßige Regulierung zu erleichtern.