Das IBIZ bearbeitet veterinärmedizinisch bedeutsame Infektionen, die durch Bakterien bei Heim- und Nutztieren, Wildtieren und Menschen hervorgerufen werden, vorrangig aus diagnostischer, differenzialdiagnostischer und epidemiologischer Sicht. Besonderes Augenmerk liegt dabei auf anzeigepflichtigen Tierseuchen, meldepflichtigen Tierkrankheiten, Tierkrankheiten mit großer ökonomischer Relevanz und Zoonosen.